六部跟内阁其实没有太大的从属关系，往朝的尚书甚至敢公然违抗内阁的命令。只是到了本朝，内阁却凌驾于六部之上，甚至能将六部管得服服帖帖。
除了嘉靖信任内阁外，还有就是嘉靖不上朝，造成了百官难得见圣上一面。两位分居的情侣会日显生疏，而隔着宫门的君臣亦是这般。
正是如此，一道屏障横在六部尚书面前