个修改很感兴趣，这也是第二部建筑师见了主角后对neo说过：观察你的反应是一件很有趣的事情。因为他也想知道先知在救世主身上的这个实验，有没有为完美世界产生客观的数据。
当然对主角感兴趣的不只是建筑师，先知也会对这一代的救世主格外关注，因为她就是想让这一代的救世主neo在见过建筑师后，选择不进入代码之源，先知料到建筑师会低估人类感情的力量，认为救世主见了自己后还是会选择进入代码之源。不过有了心上人的救世主也许会为了救心上人而放弃进入代码之源，这就是女主存在的目的，这听起来有点可悲，但却合理。
但这也是先知的一个赌注，并且胜率未知。所以为了增加赢率，先知会在第二部中瞒着建筑师暗中给他提示。所以第二部结束时，先知的这一步计划成功了，neo为了救trinity而忤逆了建筑师，没有进入代码之源。这也为matrix崩溃造成了威胁，因为只有matrix崩溃了，圈养的人类才会大面积苏醒过来。但先知仅仅做到这一步是不够的，因为全面解放人类，也会导致机器与人类全面开战，为了让人类赢得胜利，先知需要一个筹码，一个专门针对机器的筹码，这就是Smith探员。所以先知在跟主角的对话中才会提到Smith是救世主程序的反面。
在建筑师的监视下，这样的程序显然是不可能自己形成的。Smith这一程序应该是先知一手改写的。按照建筑师的说法，先知这一程序是要定期检查的，不然也会危及系统，这说明先知在matrix中的权限相当高，几乎和建筑师持平，建筑师虽能监视先知，但却无法消除这个仅次于自己的程序。因此，Smith探员就是强大的先知一手创造出来的救世主的某种镜像。所以早在Smith还是个合法程序时，他就强烈地表现出非法程序的“气质”——审问morpheus时，他想脱离matrix的愿望比neo还强。
而在救世主身上的非法程序代码，也就是力量程序被激活之时，Smith身上的非法代码也激活了——从第一部中隶属于matrix执法系统的官方程序摇身一变，成了第二部中逍遥法外的非法程序。如果说救世主是建筑师可控的非法程序的最终形态的话，那么Smith就是只属于先知的，建筑师意料之外最可怕的不可控非法程序的最终形态，因为他能同化、感染其它的程序。所以第三部中Smith会强大到威胁整个matrix的存亡，强大到让建筑师对其都无能为力的地步，这样即便失去了主角的先知，也有了能毁灭matrix的另一手准备，并因为Smith的强大只针对matrix和机器，从而几乎全面提升了人类战胜机器的希望曙光。
但主角在第三部中通过建筑师知道了先知的计划后，也知道自己中了先知的诡计，并告诉主角先知的计划是错误的，因为建筑师在决定启动完美世界计划的时候，就已经让程序与人类开始相融合了，这点是先知也不知道的。
所以当Smith感染matrix令其崩溃得时候，也就是人类全部死亡的时候。由于Smith是neo程序的反面，所以也只有neo可以凭借身体与Smith相克的代码将其毁灭，从而保证matri和人类都能活下来。
但这样一来，neo用消灭Smith为筹码与建筑师亦或是机器大帝谈判，欲要换来人类与机器之间真正的和平，最后建筑师同意了，并承诺想要自由的人类可以苏醒，但想要虚幻的人类可以继续留在matrix世界中等待完美世界的降临。
最后，主角打败了Smith，建筑师也和先知见了面，影片最后是建筑师对先知说：“你玩了一个很危险的游戏。”暗示先知下了一盘很大很大很大的棋，冒着整个矩阵毁灭的风险，算计了自己。迫使自己跟救世主妥协，给被矩阵奴役的人类自由。但是在完美世界降临前，人类与机器是不可能和平的。而后先知也会很嚣张的跟建筑师说：“她的目的尚未达到，如果人类与机器不能和平，那就等到和平结束，再博弈好了。”
听到这，安迪恍然道：“先前先知算计建筑师，是在看似同一个阵营暗中下的手。再博弈，两个程序完全明面上的对立，后续的确不好写，弄不好除了已有的故事脉络再来个四的话，一不小心整个脉络就会写崩。目前的黑客帝国三部曲脉络清晰，拍出来也会一环扣一环，除非顺序看，否则少看一部都会看不懂整个故事脉络。而且故事的设定和正反派的设定非常棒。整个《黑客帝国》系列讲的其实就是先知的这个“人类拯救计划”的执行过程，虽然这个过程和手段会在最终出现翻转局面，但从这个角度再去看《黑客帝国》三部曲，基本上就能理清所有的剧情逻辑了。”
拉里也点着头：“主角相当于一个数学模型在模拟显示样本产生的残差，在拟合的过程中，建筑师必须均衡误差，只有这样，矩阵才不会崩溃。所以建筑师是算不到neo的一切，但是 -->>
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